“只屬于自己的寶物”究竟是什么呢？故事的舞臺位于帕底亞地區，那里有著多彩的自然，人與寶可夢生活在一起?！拔蚁胝埬銈優樾律娃D學生制作一段影片，傳達學院的美好之處。”某天，有3位學生如此受到了學院校長克拉韋爾的拜托。他們分別是擅長吹奏長笛，但想要逃離演奏會帶來的壓力，性格內斂的小原；非常喜歡寶可夢對戰，一心想要打敗妮莫，性格固執的艾力奇斯；以及過分執著于尋找獨家新聞而總給他人添麻煩，性格天真的荷馬。自顧不暇的他們多少有些磨合不來。然而，隨著和寶可夢一起成長，3人的步調逐漸變得統一……